Британская Служба безопасности осуществляет свою деятельность в соответствии с полномочиями, предоставленными законом министру внутренних дел, но не является частью МВД.

Британскую Службу безопасности возглавляет Генеральный директор; в настоящее время им является Джонатан Эванс (Jonathan Evans). Заместитель Генерального директора оказывает ему поддержку и отвечает за консультации в области разведки и безопасности, контрразведку, борьбу с распространением ОМУ и за вопросы, связанные с оперативными возможностями британской Службы безопасности.

Британская Служба безопасности разделена на шесть управлений, каждое из которых возглавляет директор.

Одно из управлений, подотчетных Заместителю Генерального директора, отвечает за противодействие международному терроризму. Другое управление предоставляет консультации по вопросам защитных мер в сфере безопасности, нацеленных на противодействие разным угрозам; оно также занимается борьбой с распространением ОМУ и контрразведкой.
Третье управление отвечает за борьбу с терроризмом в Северной Ирландии и Великобритании. Последнее из четырех управлений, находящихся в ведении Заместителя Генерального директора, отвечает за управление оперативными возможностями британской Службы безопасности, такими как технические операции и проведение наблюдений.

Генеральный директор отвечает за два управления. Одно из них занимается кадрами и безопасностью МИ5. Другое отвечает за информацию, ведение документации, финансы, средства и объекты. Секретариат Службы безопасности и ее юристы оказывают содействие как Генеральному директору, так и его заместителю.